Можно ли напрямую изменить название компании после выпуска сертификата подписи кода?

Прямое изменение не поддерживается.

После выпуска сертификата подписи кода название компании в сертификате изменить нельзя. Если название компании изменилось, необходимо оформить новый заказ и заново подать заявку на сертификат под новым названием компании.